Mamíferos pequeños voladores y terrestres

Los pequeños mamíferos voladores y terrestres representaron la mayoria de los nuevos registros del grupo de mamíferos. Estudios previos a la expedición de Identidad Madidi sobre murciélagos identificaron 68 especies como línea de base. Utilizando una combinación de métodos de evaluación, se registraron 83 especies de murciélagos en total, de los cuales 35 son nuevos registros para el parque y 3 son nuevos para Bolivia. Es posible que dos de estos registros se constituyan en especies nuevas para la ciencia: Sturnira sp. nov. e Histiotus sp. Actualmente, la lista de murciélagos para Madidi alcanza a 103 especies confirmadas.

En cuanto a los pequeños mamíferos terrestre, antes de la expedición se tenían reportadas 25 especies. En los tres años de estudio se identificaron 74 especies, de los cuales 53 fueron nuevas para el parque, aumentando a 79 la lista de especies, y cuatro de las cuales son candidatas para la ciencia. Algunas de de las especies reportadas por primera vez en Madidi fueron: Chinchillula sahamae, observada en los hábitats del páramo yungueño y altoandino; Nectomys apicalis, una rata acuática del bosque de piedemonte del alto Madidi; Dactylomys boliviensis, la rata del bambú del bosque montano de Mamacona; la carachupa cuatro ojos, Philander canus, y la carachupita Cryptonanus unduaviensis, ambas especies registradas en las pampas del Heath; y Lestoros inca, un marsupial de los bosques de ceja de monte, que representa además el segundo registro para el país.