El tercer sitio de estudio, en la región altoandina, comprende zonas montañosas entre 4.100 y 4.900 m s.n.m., se caracteriza por la presencia de extensas mesetas planas a onduladas, atravesadas por cordones montañosos. La temperatura varía entre 0 °C a 9 °C. La vegetación se caracteriza por la presencia de pastizales bajos con predominancia de gramíneas y plantas en rosetas. La presencia de keñua (Polylepis spp.) y de bofedales es también característico de esta zona.

En total, se registraron 55 especies de plantas, 4 especies y subespecies de mariposas diurnas y 81 especies de vertebrados, de las cuales 29 son especies nuevas para Madidi y una especie es candidata para ciencia.